为了保证每个虚拟站点都能够拥有自己独立的文件访问权限，我们需要安装Apache安全权限分离模块，在终端中输入：
sudo apt-get install apache2-mpm-itk
接下来我们需要再添加一个后台站点的Apache运行帐号，在终端中输入：
sudo useradd -g www-data -d /dev/null -s /usr/sbin/nologin www-admin
这样我们就添加了一个www-admin帐号，专门用于控制后台站点的文件访问权限。
默认安装后，后台的管理目录是在站点更目录下的/dede，为了安全起见我们需要将这个目录移出，但为了能够正常管理站点，我们需要将这个后台目录创建独立站点。
3.1.移动后台管理目录
我们先创建一个目录，这个目录专门用于存放后台站点文件，在终端中输入：
sudo mkdir /var/dedecms-admin
然后将织梦后台移动到这个文件夹中，输入：
sudo mv /var/dedecms/dede/* /var/dedecms-admin/
3.2.创建虚拟站点
我们需要创建一个新的站点用于显示后台，我们可以在/etc/apache2/site-enabled/目录中创建一个文件名为：default-admin的文件，内容如下：
<VirtualHost *:80>
ServerName admin.dede.com
ServerAdmin [email protected]
DocumentRoot /var/dedecms-admin
AssignUserId www-admin www-data
<Directory />
Options FollowSymLinks
AllowOverride None
</Directory>
<Directory /var/dedecms-admin/>
Options Indexes FollowSymLinks MultiViews
AllowOverride None
Order allow,deny
allow from all
</Directory>
</VirtualHost>
创建完成后我们重新启动服务器，在终端输入：
sudo service apache2 restart
这里我们给后台站点域名设置为admin.dedecms.com用户可以根据自己情况设定更为复杂的域名形式，例如：dedesiteadmin2008.dede.com
然后在系统host纪录中添加一条指向站点域名对应ip的纪录，保证其能够正常访问。
3.3.给管理站点目录设定权限控制帐户
为了保证后台文件访问的安全，我们也需要给它设定文件访问权限，在终端中输入：
sudo chown www-admin.www-data /var/dedecms-admin/
这样就给这个目录指定了www-admin的访问帐号。
3.4.调整后台文件配置，保证后台正常访问
由于我们直接移动了管理后台文件目录，所以我们访问admin.dede.com会出现报错，这时候我们需要对系统中的目录配置进行调整。
(1)找到/var/dedecms-admin/config.php，将第12行
require_once(DEDEADMIN.'/../include/common.inc.php');
改为
require_once(DEDEADMIN.'/../dedecms/include/common.inc.php');
然后在这段代码下面加上：
$cfg_plus_dir = $cfg_phpurl = $cfg_basehost."/".$cfg_plus_dir;
(2)找到/var/dedecms-admin/login.php，将11行
require_once(dirname(__FILE__).'/../include/common.inc.php');
改为
require_once(dirname(__FILE__).'/../dedecms/include/common.inc.php');
(3)找到/var/dedecms/data/safe/inc_safe_config.php，第2行，改为
$safe_gdopen = '1,2,3,4,5,7';
(4)找到/var/dedecms-admin/exit.php，第11行
require_once(dirname(__FILE__).'/../include/common.inc.php');
改为
require_once(dirname(__FILE__).'/../dedecms/include/common.inc.php');
(5)复制include中的相关文件
我们需要将include文件夹下的一些文件拷贝到管理后台站点中以保证后台正常使用：
mkdir /var/dedecms-admin/include/dialog
sudo cp -R /var/dedecms/include/dialog/* /var/dedecms-admin/include/dialog
mkdir /var/dedecms-admin/include/js
sudo cp -R /var/dedecms/include/js/* /var/dedecms-admin/include/js
sudo mkdir /var/dedecms-admin/include/ckeditor
sudo cp -R /var/dedecms/include/ckeditor/* /var/dedecms-admin/include/ckeditor
设定完成后我们需要给前台站点重新指派权限，在终端输入：
sudo chown -R www-admin.www-data /var/dedecms/
这样就把前台用户设定为了www-admin，然后再执行：
sudo chmod -R 755 /var/dedecms/
这样设置后后台管理就具有了站点操作权限，但前台浏览用户没有修改文件的权限了。
但这里前台uploads需要有可上传的权限，所以还需要执行：
sudo chmod -R 777 uploads/
这样一来我们就完成了系统的安全设置，做到了前后台的权限分离，当然您也需要配置下php.ini禁用掉某些函数，配合系统做好各个方面的安全设置。
如果您需要了解Windows Server 2012下如何搭建配置DedeCMS环境，可以查看：《Windows Server 2012 搭建PHP+MySQL环境安装DedeCMS系统》 由于Nginx轻便容易维护，很多站长也会选择Nginx作为站点服务器，设置思路同上文类似，但有稍许的不同，下面我们就来单独对其进行介绍。
6.1.安装Nginx以及php5-fpm
终端中输入：sudo apt-get install nginx
以及：sudo apt-get install php5-fpm
（如果已经安装了Apache的用户需要停止Apache，以免同Nginx冲突，可以使用命令行：sudo service apache2 stop）
6.2.添加站点
同样我们需要添加两个站点，一个前台“www.server110.com”一个后台“admin.server110.com”，基本配置如下：
www.dede.com站点：
server {
root /var/dedecms;
index index.html index.htm index.php;
server_name www.server110.com;
...
location ~ .php$ {
fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /var/dedecms$fastcgi_SCRIPT_FILENAME ;
fastcgi_index index.php;
include fastcgi_params;
}
}
admin.dede.com站点配置：
server {
root /var/dedecms-admin;
index index.html index.htm index.php;
server_name admin.server110.com;
...
location ~ .php$ {
fastcgi_pass 127.0.0.1:9001;
fastcgi_param ｓｃｒｉｐｔ_FILENAME /var/dedecms-admin$fastcgi_ｓｃｒｉｐｔ_name;
fastcgi_index index.php;
include fastcgi_params;
}
}
这里主要是admin的站点采用的9001端口，以及站点目录重新做了调整。
6.3.指派站点文件访问控制权限
同apache的apache2-mpm-itk不同，php5-fpm默认就可以进行权限控制。
在文件/etc/php5/fpm/pool.d/www.conf中则是默认采用了“www-data”作为站点的控制用户，所以为了后台具有对应的操作权限，我们需要添加一个专门的控制权限。
cd /etc/php5/fpm
cp www.conf admin.conf
修改admin.conf文件
其中我们只要将：
user = www-admin
group = www-data
listen = 127.0.0.1:9001
这几个地方做一个更改即可。
完成后重启下服务
sudo service php5-fpm restart
sudo service nginx restart
6.4.nginx下取消目录执行的权限
在《Linux下安装DedeCMS及安全设置》 中介绍了apache下如何取消目录执行权限，nginx也是类似，但配置方法稍有不同：
server {
...
location ~* ^/uploads/.*.(php|php5)$
{
deny all;
}
}
按照这个方法，将其他目录也同样设置即可。