Ubuntu下安装R很方便，可以在软件管理中心搜索r-base直接安装，也可以将CRAN的相关目录添加到源，然后通过apt-get安装：
sudo apt-get install r-base
不过一旦想清楚地知道R安装过程中的细节并控制相关的设置，可以采用手工编译.tar.gz的方式安装。
首先需要到CRAN上下载R的源码包（用wget命令下载：wget URL），我使用的是最新的版本R-3.1.0.orig.tar.gz。将其拷入某个目录，并解压缩：
tar -zvxf R-3.1.0.orig.tar.gz
然后进入目录R-3.1.0，运行./configure检查安装的依赖环境并配置安装文件：
./configure --prefix=/home/me/R --enable-R-shlib
注意prefix参数可以设置R将要安装的路径，enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享，这个选项一定不要忘记添加，否则以后安装某些包的时候会出现Error in dyn.load的错误。
系统会提示未找到G77编译器的错误，需要安装一个gfortran，当然安装g77也能顺利编译通过，不过新版本的Ubuntu不再提供g77的源，需要配置旧的aptitude的方式，并且有些新的R包用g77编译会出问题，所以使用新的gfortran比较保险。此外还需安装build-essential，提供C/C++的编译环境，否则也会报错。
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install gfortran
一旦出现错误：configure: error: –with-readline=yes (default) and headers/libs are not available，需要安装libreadline6-dev：
sudo apt-get install libreadline6-dev
一旦出现错误：configure: error: –with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available，需要安装libxt-dev：
sudo apt-get install libxt-dev
所有依赖包安装好之后，配置就可以成功，此时进行编译就能成功：
make
make install
安装结束后需要手动设置环境变量，可以打开.bashrc文件，添加R_HOME和R_LIBS变量，并修改PATH，这样R就完全安装好了。